부모님이 돌아가신 루이는 할아버지와 함께 시골 마을의 산기슭에서 살아간다. 할아버지 베르나르 영감은 사람들과 어울리지 않고, 집 안에 틀어박혀서 미생물만 연구하는 사람이다. 어느 날 루이네 집에 파스퇴르 연구소의 부소장 뮈세 박사가 찾아와 도난당한 세균 ‘메두사’를 찾아 달라고 부탁한다. 알고 보니 베르나르 영감은 예전에 탐정이었다. 사건을 해결하기 위해 파리로 간 루이와 할아버지. 루이는 부모님이 파스퇴르 연구소의 연구원이었다는 사실을 알게 되고, 옆집에 사는 아빠 친구 아들인 레오와 친구가 된다. 루이와 할아버지는 더 이상 사건에 관여하지 말라는 협박 편지를 받고, 사건을 해결하러 다니던 할아버지도 실종되고 만다. 루이는 레오와 대장, 꼬마 등 친구들의 도움을 받아 할아버지가 남긴 수첩 속 수수께끼를 풀면서 할아버지를 찾아 나서는데…….

눈에 보이지 않을 만큼 작지만 우리 몸을 지켜 주고, 우리가 살아가는 데 꼭 필요한 소중한 생명체가 무엇일까? 바로 미생물이다. 맛있는 치즈와 식빵을 만들어 주고, 병을 치료하는 약의 원료가 되고, 생태계를 청소해 주는 것도 미생물이 하는 일이다. 미생물에 대해 더 알고 싶다면 꼬마 탐정단과 함께 미생물 메두사를 훔쳐 간 범인을 추적해 보자. 루이와 레오와 함께 범인을 추적하다 보면, 흥미로운 미생물의 세계를 자연스럽게 배울 수 있다!<br/><br/><b>1. 범인을 찾으며 만나는 놀라운 미생물의 세계 </b><br/>프랑스의 시골 외딴집에 사는 루이의 할아버지 베르나르 영감은 ‘메두사’라는 무시무시한 미생물을 찾아 달라는 부탁을 받는다. 하지만 수사 도중 베르나르 영감은 사라지고 만다. 루이는 사라진 할아버지와 메두사를 훔쳐 간 범인을 찾아야 하는데, 그 과정에서 꼭 필요한 것이 바로 미생물 지식이다. 할아버지가 남긴 수수께끼와 단서들이 모두 미생물과 관련이 있기 때문이다. ‘자물쇠와 열쇠 미생물을 주의 깊게 살펴라’라는 수수께끼 속에 질병을 일으키는 미생물과 그 질병을 예방하는 백신에 관한 이야기가 숨겨져 있는 식이다. 루이가 친구 레오와 함께 수수께끼를 풀고, 범인을 찾아 나가는 흥미로운 이야기가 펼쳐지면서, 미생물 정보가 자연스럽게 전달된다. 보기만 하면 없애 버려야 할 것 같은 곰팡이가 사실은 자연계를 청소해 주는 존재이며, 치즈, 빵 등 맛있는 음식들이 미생물에 의한 발효로 만들어진다는 사실, 피부를 비롯한 우리 몸 곳곳에 미생물이 살면서 우리의 건강을 지켜 준다는 사실 등 미생물에 대한 알찬 정보가 하나하나 소개된다. 독자들은 두 소년의 추리 과정에 함께하면서 미생물에 대해 흥미롭게 배울 수 있다. <br/><br/><b>2. 풍부한 미생물 지식을 만나는 알찬 정보 코너 </b><br/>수수께끼를 풀고 범인을 추적하는 흥미로운 이야기 뒤에는 교과서 정보를 체계적으로 설명해 주는 코너가 기다린다. '호기심 팡팡! 지식이 쑥쑥!'에서는 이야기 속에서 미처 다 다루지 못한 미생물 정보들이 상세하게 소개된다. 현미경의 사용법과 미생물의 개념, 원생생물, 세균과 고세균, 바이러스, 곰팡이, 질병을 일으키는 미생물, 효모 같은 음식을 만드는 미생물, 땅을 살리는 토양 미생물, 환경을 살리는 미생물 등 미생물에 대한 모든 정보가 담겨 있다. 파스텔톤의 친근한 일러스트는 아이들의 이해를 돕는다. <br/>'찾아라! 미생물 사냥꾼'에서는 역사적으로 유명한 미생물학자들을 소개하면서, 그들이 이루어 낸 미생물학의 발전 과정을 알아본다. 최초의 항생제인 페니실린을 발견한 알렉산더 플레밍, 우두 접종법을 발견한 에드워드 제너, 저온 살균법을 개발한 루이 파스퇴르 등 질병 치료와 예방에 대해 연구해 오늘날 우리의 삶을 건강하고 풍요롭게 만들어 준 위대한 미생물학자들의 이야기가 흥미롭게 펼쳐지며, 미생물에 대한 깊이 있는 정보도 얻을 수 있다. <br/><br/><b>3. 새롭게 눈뜨는 생명의 세계 </b><br/>미생물이라고 하면 흔히 질병을 일으키거나 우리의 생활과는 관련이 없는 과학자들의 실험실 속에 존재하는 것으로 생각하기 쉽다. 하지만 책을 읽으며 미생물의 세계를 알고 나면, 우리 주변 어디에나 있으며 우리의 삶에 없어서는 안 될 중요한 존재라는 걸 알 수 있다. 미생물들이 얼마나 많은 일을 하는지, 그 신비한 이야기를 통해 아이들은 눈에 보이지 않는 작은 생명체들의 소중함을 느낄 수 있을 것이다.