9살에서 18살 사이 100여 명의 소년으로 구성된 합창단으로 종교 합창 음악을 주로 노래한다.
합창단원들은 '토마스 알룸나트(Thomasalumnat)'라는 기숙사에 머물면서 '라이프치히 토마스 학교(Thomasschule)'에서 교육을 받는데, 이 학교에서는 언어와 음악 교육에 중점을 둔다.

성 토마스 합창단은 1212년 디트리히 1세(마이슨 후작 테오도릭 1세 또는 전쟁공 디트리히)가 창단하였다. 그 뒤 저명한 음악가들이 '토마스칸토르(Thomaskantor)'라는 이름으로 합창단을 지휘하였으며, 요한 세바스티안 바흐도 1723년에서 1750년에 토마스칸토르로 재직하였다.

오랜 역사만큼이나 다양하고 뛰어난 실력으로 800년이 넘도록 그 명성을 이어가고 있다. 그레고리오 성가부터 현대 합창 음악까지 폭넓은 레퍼토리를 보유하면서도 '성스러운 음악(Musica Sacra)'을 보전하는 것에 중점을 둔다. 1900년대 들어 정기적으로 국내 및 해외 투어를 개최하며 국제적 명성을 얻기 시작한 합창단은 세계 각지에서 바흐의 작품을 비롯한 여러 음악을 선보이면서 문화대사로 자리매김하였다.