프랑스 스트라스부르의 귀족 집안에서 태어났다. 어린 나이에 부모가 차례로 잃고 외할아버지 댁에 자라며 파리에서 중학교를 졸업했다. 이후 육군사관학교를 졸업하고 장교가 된 그는 알제리아에서 일어난 반란군 진압을 위해 그곳에 갔다가 북아프리카에 매혹된다. 제대후 모로코에 대한 과학 탐사를 위해 알제리아에 거주하면서 이슬람교도들이 깊은 신앙심에 따라 살아가는 모습을 보고 깊은 감명을 받는다.

이후 가톨릭으로 귀의(歸依)하여 오랜 수도원 생활을 거쳐 43세인 1901년 사제 서품을 받은 후, 당시 세상에서 가장 버림받은 사람들이 살고 있던 사하라의 베니-아베스로 들어가 원주민들과 더불어 살며 복음을 전했다. 1916년 12월 1일, 한 원주민이 쏜 총에 맞아 숨질 때까지 그는 ‘예수성심의 작은 형제회’와 ‘예수성심의 작은 자매회’를 알제리아에 창설했다. 그리고 그들의 숫자가 엄청나게 늘어나 예수님과 똑같이 살아가려고 노력한 샤를르 드 푸코의 숭고한 정신을 오늘날까지도 이어가고 있다.