1975년, 한양대학교 의과대학을 졸업하고 동대학원에서 석· 박사를 취득하였다. 미국 노스웨스턴 대학과 사우스캐롤라이나 대학에서 연수했으며, 1983년 한양대학교 의과대학 내과학교실 교수로 부임해 현재까지 한양대학교병원 소화기내과 교수로 재직 중에 있다.
한양대학교 구리병원 병원장(2003~2005)을 역임했으며, 대한췌담도학회 회장, 대한소화기내시경학회 이사장, 대한소화기학회 회장, 한국 기독의사회 회장, 성산생명윤리연구소 소장 을 역임했다.
대한내과학회, 대한소화기학회, 미국소화기학회 정회원이며, 월간 『건강과 생명』 편집위원으로 활동하고 있다. 저서로 『함준수 박사의 건강노트』,『담즙색소(담즙연구입문)』,『건강길잡이(행복한 노후를 위한 지혜)』,『함준수 박사의 건강 길잡이』,『인생 2막을 건강하게』등이 있으며, 공저로 『대한소화기내시경학회 세미나 모음집』 ,『알기 쉬운 위장학』,『이것이 나의 간증이요(서울기독의사회 간증집)』,『생활속의 의학』,『소화기 내시경학』,『담도학』등이 있다.