반핵의사회는 △모든 핵발전의 중단과 재생에너지로의 전환 △ 모든 핵무기의 즉각 폐기 △ 진단용 치료용 방사선 사용 최소화를 위해 노력한다. 반핵의사회는 방사선 인체영향에 대한 학술연구와 핵시설과 방사능 물질의 안전성 검증 등의 역학조사 및 핵발전과 방사선의 위험성을 알리는 교육홍보 활동과, 국내외 반핵단체-환경단체들과 연대활동을 하고 있다.