충북 음성에서 태어나 충주고등학교와 연세대학교 행정학과를 졸업했다. 이후 뉴욕주립대인 스토니브룩대학에서 기술과학경영학 석사학위를 취득했다. 1996년 동아일보에 입사해 사회부, 경제부, 산업부, 정치부 등을 거친 뒤 워싱턴 특파원으로 부임했다. 채널A에서는 〈박정훈의 뉴스 TOP10〉 앵커를 맡았고, 2019년 TV조선으로 이직해 〈뉴스7〉 앵커, 정치부장 등으로 일했다. 2023년부터는 시사제작국장으로 〈박정훈의 정치다〉를 진행해왔다.