인돈학술원은 미국 남장로회 한국선교회가 고등교육을 통한 기독교 인재 양성을 목표로 1956년에 설립한 한남대학교의 부설연구원으로, 대학 설립 위원장이자 초대 학장을 역임한 인돈(William A. Linton) 박사의 비전과 헌신을 기리고, 대학의 창학정신과 교육이념을 계승하기 위한 연구와 교육과 문화사업을 지원하기 위해 1994년에 출범하였다. 특히 인돈학술원은 미국 남장로회 한국선교 관련 사료를 발굴 및 보존하고, 그것을 토대로 연구, 교육, 출판사업을 수행함으로써 미국 남장로회 선교 역사에 관한 학술연구를 발전시키고, 학술적 성과를 한국교회와 사회에 확산시키는 노력을 기울이고 있다.