1997년부터 만화 그리는 작업을 하기 시작했다. 그린 책으로는 《톰소여의 모험》, 《세계사-터키편》, 《파브르 곤충기》, 《노벨》, 《꿀벌 마야의 모험》, 〈NEW 서울대 선정 인문고전 60선〉 중 《노자 도덕경》, 《베르그송 창조적 진화》 등이 있다.

서울대학교에서 지구과학을 공부했다. 중·고등학교 과학 교사로 근무했으며, 중학교 과학 교과서와 교사용 지도서를 집필했다. 그동안 『청소년을 위한 서양 과학사』, 『엉뚱한 생각 속에 과학이 쏙쏙』, 『손영운의 우리 땅 과학 답사기』 등을 펴내, 과학창의재단의 우수 과학 도서로 선정되었다. 기획한 책으로 『서울대 선정 만화 인문고전 60선』, 『이어령의 교과서 넘나들기』, 『닮고 싶은 창의융합 인재』 등이 있으며 지금은 지역 신문에 「손영운의 과학 이야기」를 기고하는 과학 칼럼니스트이면서, 청소년을 위한 과학 관련 책들을 쓰는 과학 작가로 활동하고 있다.