수혹성연대기 3권에서는 작품의 중심 소제 중 한 가지가 등장합니다. 피오나 블랙 부녀가 달에서 고대 인류가 남긴 유적과 빛을 흡수해서 열과 산소와 물을 생산하는 나무를 발견합니다. 이를 통해 수혹성연대기의 주제를 보여 줍니다.

미려한 화풍과 감성적인 전개로 착각하기 쉽지만 수혹성연대기의 지구는 멸망해가고 있습니다. 지구온난화로 기온은 계속 오르고 인류는 거주 가능지역이 꾸준히 줄어가고 있습니다. 일부 섬은 해수면 밑으로 가라앉고 화석연료 사용을 제한하고 있으며 궤도엘리베이터를 건설하는 등 생존을 위해 우주로 진출하려고 합니다. 그 과정에서 달기지를 건설한 와중에 고대 인류의 유적을 발견하고 고대 인류가 살던 지구 역시 멸망을 향해 치달았으며 그들 역시 멸망을 피해 우주로 진출한 인류와 지구에 잔류한 현 인류의 조상으로 나뉘었던 것을 알게 됩니다. 즉 지구는 오래전부터 멸망과 재생을 반복하고 있었던 셈입니다.어쩌면 1권에서 등장한 통조림과 앨리스 에피소드편, 이민선단의 주인은 고대 인류 였을 수도 있습니다.

멸망해가는 행성이라는 점은 3권의 등장인물들이 살아가는 배경에서 여실하게 보입니다. 인물의 동선에서 항상 등장하는 우거진 수풀과 버려진 기계와 건물, 사람이 삻지 않는 구시가지, 배와 수상가옥에서 살아가는 사람들. 하지만 인물들은 시종일관 적극적이고 밝고 억척스럽게 살아갑니다. 마지막 에피소드 요정이 사는 황혼에서 늙은 화가가 보는 요정과 어머니된 소녀와 새생명인 아이를 통해 멸망과 그 속에서 희망을 찾는 모습은 작가가 말하고자하는 주제라고 생각합니다.