현재의 이사장 프랑켄슈타인은 학생이자 주인인 라이와 애매한 관계로 함께 지내며, 라이가 오랜 기간 모습을 감춘 배경에 대해 조사하기 시작한다. 그 과정에서 숨겨진 힘을 찾아 연구를 지속해 온 또 다른 인간들과 마주치고 싸움에 휘말리게 된다. 또한 그들이 속해 있는 ‘노블레스’라는 집단의 존재와 정체에 대해서도 점차 알게 되는데….

타오와 타키오는 세이라와 프랑켄슈타인에게 싸우다 지고 M-21은 크랜스에게 싸움에서 불리하게 되는데

라이의 등장으로 아이들은 물론이고 M-21도 레지스도 목숨을 구하게 된다 그리고 상처를 입은 타오와 타키오는 싸움의 끝에 프랑켄슈타인의 집으로 가게 되고 M-21의 부탁으로 이들도 같이 지내게 된다

프랑켄슈타인은 개조인간인 그들을 위한 약을 제조하고 같이 살게 된다 한편 DA-5의 전멸로 인해 조사단이 파견되는데 바로 DA-5를 만든 닥터 아리스다

닥터 아리스의 등장과 함께 유리라는 남자도 아리스와 함께 오는데 세이프 하우스에서 벌어진 일들을 조사하던 중 아리스는 프랑켄 슈타인을 발견하고 유리에게 그를 납치해오라고 명령한다

유리는 이상한 연기를 써서 프랑켄슈타인을 닥터아리스에게 데려가고 닥터 아리스는 프랑켄슈타인을 실험체로 사용하겠다며 흥분한다 한편 라이와 나머지 일행들은 프랑켄슈타인이 돌아오지 않자 걱정하며 프랑켄슈타인을 찾으러 나선다 그리고 타오와 타키오가 있던 세이프하우스로 향하는데 거기서 프랑켄슈타인은 그 집에서 나가려다가 닥터 아리스의 신경을 건들이고 아리스는 프랑켄을 어떻게든 실험체로 쓰려하다 그만 엄청난 싸움이 벌어지는데... 그 싸움장소에 타오가 등장하고 타오가 등장하면서 그의 엄청난 비밀이 밝혀지는데...

프랑켄슈타인과 라이가 살고 있던 집에 이제는 많은 사람들이 살게 되었다 M-21과 세이라와 레지스

여기에 타오와 타키오까지 정말 많은 사람들이 그 두사람의 집에 머물게 된다

점점 흥미로워지는 가운데 닥터 크롬벨의 속셈도 궁금해지기 시작했다 과연 크롬벨은 무얼 노리고 있는 것일까 여기에 닥터 아리스와 유리의 등장도 심상치 않다 시즌3를 빨리 읽고 싶다