한국고고학회는 1976년에 한국 고고학계에서는 가장 먼저 전국 규모로 결성되었으며 현재 국내의 고고학연구자는 물론 국외의 한국고고학 연구자를 거의 모두 회원으로 망라하고 있어서 명실상부하게 한국 고고학계를 대표하는 학술모임이다.
학회의 운영도 그에 걸맞게 총회·평의원회·운영위원회·편집위원회 및 각종 소위원회 등 역할과 임무를 달리하는 다양한 기구를 통해 조직적으로 이루어지고 있다. 특히 다른 학회에서는 거의 유례를 볼 수 없는 기구인 평의원회는 회장과 전국 각 지역을 대표하는 20명 내외의 위원으로 구성되어 학회의 중요한 사업과 정책을 결정하며 이를 통해 학회가 전체 회원들의 의사를 최대한 반영하여 민주적으로 운영되고 있다.