총파업의 위력은 곧 나타났다. 파업 소식이 알려지자 응급실 내원 환자가 줄었다. 병동의 환자는 떠밀리다시피 퇴원을 당했다. 원하지 않는 퇴원 과정에서 환자, 보호자와 옥신각신하는 일도 빚어졌다. 병원 측에서 새 노조에 상황을 정확히 알리고 함께 수습하자고 요청했다면 혼란을 줄일 수도 있었을 것이다. 실제 새 노조는 이러한 혼란을 수습하고 비상 상황에 대비하기 위하여 ‘응급 대기반’을 편성하고 있었다. 그러나 병원 측은 혼란 수습에 나서기보다 새 노조의 조정 절차에 따른 합법 파업을 불법이라며 조합원 개개인에게 손해배상을 청구하겠다는 등의 겁박에 더 집중했다.
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4월부터 3개월에 걸친 집중 교섭에도 끝은 보이지 않았다. 그런데 6월 말 또 다른 변수가 생겼다. 바로 진주의료원을 폐업하고 국회 국정조사마저 거부한 홍준표 경남 도지사의 양산 분원 특강이었다. 홍 지사가 7월 15일 양산에 있는 부산대 의학전문대학원에 연구소 건립비 100억 원을 지원하는 업무협약(MOU) 체결을 위해 내원하여 병원 임직원에게 특강을 한다는 것이다.

“영남권의 대표적 공공의료기관인 양산부산대병원에 공공의료 파괴 주범 홍준표 지사의 출입 자체를 인정할 수 없다. 만약 특강이 강행된다면 이는 부산대학교병원에 대한 심각한 모욕으로서 결코 좌시하지 않을 것임을 분명히 밝힌다.”

특강 사실을 파악한 부산대병원지부는 “공공의료 파괴, 홍준표 도지사의 양산부산대학교병원 특강을 즉각 취소하라!”라는 성명을 발표하며 반발했다. 이뿐만 아니다. 민주노총 양산시지부와 양산진보연합 등의 노동·시민사회단체가 양산 분원 앞과 시내 중심가에 현수막을 내걸고 특강 취소를 촉구했다. 또한, 부산대병원지부는 7월 8일부터 양산 분원 식당 앞에서 중식 선전을 진행하여 특강의 부당성을 알려나갔다.
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또한, 국립의료원 공무원노조에서는 법인화 법률 제정 과정에서 진행된 정책 개입 활동과 같이 국회를 적극적으로 활용했다. 핵심은 국립중앙의료원 설립추진위원회와 실무추진단에 시민사회단체와 함께 참가하는 것이다. 물론 거부됐다. 이후 노동조합은 국회를 통하여 설립추진위원회와 실무추진단의 회의록을 요청하고 국정감사 등에 대응하는 방식으로 전환해 공공의료 강화와 노동조건 개선에 주력했다.

공공의료 강화와 관련해 국립의료원 공무원노조는 건양대에서 충남대로 옮긴 김철웅 교수의 도움을 받았다. 몇 차례의 간담회가 이어졌고 간담회의 결과는 곧바로 정책의견서로 작성하여 국회 등에 전달했다. 또한, 김 교수의 칼럼 기고문 “지방의료원 민영화의 폐해와 공공성 추구의 길”을 돌려 읽으며 법인화의 미래를 가늠해 보았다.
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노동조합 사무실이 갖춰지면서 조직화 활동은 한층 달아올랐다. 부산본부도 이에 호응하여 매주 2~3일씩 서울 본원 간부들과 함께 현장을 순회했다. 몇 시간의 짬을 내어 진행되는 현장 순회는 잦았지만, 노동조합 사무실을 온종일 운영하는 것은 또 다른 고민이었다. 사무실은 있는데 근무자가 없으면 오히려 비난이 쏟아질 수 있기 때문이다. 물론 사무실 공사가 가시화되면서 대책을 세웠었다. 4월 15일 한용문 보건의료노조 부위원장을 중심으로 열린 대책 회의에서는 중앙 간부들이 화요일부터 금요일까지 맡되 부산본부에 신임 간부가 채용되면 추가 논의를 하는 것으로 결정했다.