저자의 말 — 나는 왜 이 책을 쓰게 되었는가
서문 — 1%의 뇌, 무한의 질문

제1부. 과학과 신앙은 적이었는가
1장. 갈릴레오의 오해 — 종교와 과학 갈등 신화의 해체
2장. 뉴턴, 멘델, 르메트르 — 신앙인이었던 과학자들
3장. 환원주의의 승리와 그 한계 — "뇌가 곧 마음"이라는 주장
4장. 왜 지금 다시 신을 묻는가 — 21세기 신경과학의 자기 고백

제2부. 물질주의 뇌과학이 그리는 인간
5장. 뉴런, 시냅스, 그리고 의식의 환영
6장. 자유의지는 환상인가 — 리벳 실험과 그 이후
7장. "신은 뇌가 만든 망상이다" — 도킨스, 데닛, 해리스의 주장
8장. 그러나 설명되지 않는 것들 — 의식의 어려운 문제

제3부. 신을 만나는 뇌 — 신경신학의 발견
9장. 기도하는 뇌 — 앤드루 뉴버그의 SPECT 영상
10장. 명상하는 수도자, 묵상하는 수녀 — 전두엽과 두정엽의 변화
11장. 방언(글로솔라리아)의 신경학적 미스터리
12장. 임사체험과 신비체험 — 측두엽의 문이 열릴 때
13장. 회심의 순간, 뇌는 무엇을 경험하는가

제4부. 영성이란 무엇인가
14장. 경외(Awe) — 별, 바다, 산 앞에서 작아지는 뇌
15장. 디폴트 모드 네트워크와 자기 초월
16장. 재즈처럼 사는 뇌 — 규칙과 자유의 신경학적 변주
17장. 종교 없는 영성도 가능한가 — 무신론자의 신비체험
18장. 절대자 없이는 설명되지 않는 것들 — 미세조정, 의식, 사랑

제5부. 영성으로 사는 삶, 몸이 응답한다
19장. 이웃을 사랑할 때 — 옥시토신, 미주신경, 보상회로
20장. 이타심의 신경생물학 — 주는 자의 텔로미어
21장. 감사와 용서 — 우울과 불안을 녹이는 처방전
22장. 기도와 면역 — 텔로미어, 염증지표, NK세포
23장. 통증의 뇌, 위로받는 뇌 — 만성 통증과 절대자의 만남
24장. 신앙공동체와 수명 — 블루존의 비밀
25장. 트라우마, 중독, 그리고 영적 회복

제6부. 우리가 모르는 99%
26장. 뇌과학이 아직 답하지 못한 질문들
27장. 의식은 뇌에서 나오는가, 뇌를 통해 흐르는가
28장. 양자물리학과 의식 — 펜로즈와 하메로프의 가설
29장. 진화는 왜 영성을 선택했는가

결론 — 뇌 안의 숨결