이상규 교수는 고신대학교 신학과와 신학대학원, 그리고 대학원을 거쳐 호주 장로교신학대학(PTC)에서 교회사를 연구하고 호주신학대학(ACT)에서 신학박사 학위(ThD)를 받았다. 미국 Calvin College과 Associated Mennonite Biblical Seminary 방문교수였고, 호주 Macquarie University 초기기독교연구소 연구교수였다(2002-2003). 고신대학교 신학과 교수로 봉직하고 은퇴하였고, 지금은 서울 백석대학교 석좌교수로 있다.
통합연구학회 학술상(1991)을 수상한 이래 한국교회사학연구원 학술상(2010), 기독교문화대상(2010), 올해의 신학자상(2012), 한국복음주의신학회 학술상(2018)을 수상했다. 한국장로교신학회와 개혁신학회 회장을 역임하였고, 현재는 국제신학학술지, Unio Cum Christo와 Reformed Theological Review의 편집위원이기도 하다.
저서로는 『교회개혁사』, 『해방전후 한국장로교회의 역사와 신학』, 『초기 기독교와 로마 사회』 등이 있고, 『초대교회에서의 전쟁과 평화』, 『베어드의 선교일기』 등을 번역했다.