고도의 문명으로 발전한 바이오 별은 과학으로 만들어진 물질 활성화 바이오 입자를 둘러싸고 전쟁으로 망하고 만다. 바이오 입자를 평화적으로 이용하길 바란 바이오 별 평화 연합 사람들은, 우주에서 가장 아름다운 별 지구에서는 자신들처럼 과학을 둘러싼 비극을 되풀이안된다는 마음으로 자아를 가진 거대 로봇 바이오 로보와 서포트 로봇 피보를 지구로 보낸다.

500년 후. 독타맨이라 불리는 천재 과학자가 자기가 만든 메카 클론으로 신 제국 기아를 세워 세계를 정복하려 하고, 지구의 위험을 알게 된 피보는 5명의 젊은이들을 소환한다. 그들은 500년 전, 바이오 로봇에게 육체와 정신을 강하게 만드는 바이오 입자를 받은 5명의 젊은이들의 자손들이다.

숙명으로 이어진 5명의 젊은들이 바이오맨으로서 기아에 맞서게 되지만, 기아의 거센 공격에 옐로가 목숨을 잃는다. 남겨진 네 사람은 바이오 입자를 가진 야부키 준을 동료로 받아들이고, 기아와의 숙명적인 전쟁에 다시금 뛰어든다.

● 에피소드
[Disc 1]
1화 수수께끼의 거대로봇 출현
2화 집합! 숙명의 전사
3화 우리 친구 바이오 로봇
4화 자폭! 메카인간
5화 보이지 않는 적을 무찔러라
6화 일어나라! 바이오 로봇

[Disc 2]
7화 붙잡힌 피보
8화 싸워라! 별을 걸고
9화 사람을 사라지게 만드는 줄넘기
10화 안녕 옐로
11화 신전사 쥰 등장

신제국기어의 총통ㆍ독타맨은 공격목표를 일본으로 결정, 본격적인 침략활동을 개시했다.
이에 호응하듯, 갑자기출현한 수수께끼의 거대로봇.
로봇은 5명의 젊은이를, 후지산 산기슭에 모였다. 5명은, 체내에”바이오 입자”를 가진 숙명의 전사였던 것이다. 젊은이들은, 초 전자 바이오맨이 되어 기어와의 싸움에 참가한다.

[Disc 3]
12화 살인자 그린!
13화 쥰이여!
14화 신 두뇌 브레인!
15화 여전사 불꽃의 맹세
16화 달려라 21599초

[Disc 4]
17화 나는 용궁 성을 보았다
18화 초능력소녀의 기도
19화 아버지는 닥터맨
20화 프린스의 도전!
21화 지켜라 바이오 베이스

독탄맨의 아들ㆍ프린스가 출현했다. 프린스는 재생하는 메카쟈이칸ㆍ구로테스칸스를 타고, 바이오맨에게 싸움을 건다.
과연 독탄타맨은, 프린스의 진짜 아버지 인 것 일까?
이윽고, 의외의 프린스 정체가 밝혀지다!

[Disc 5]
22화 대도둑?! 블루
23화 인형의 습격
24화 폭발하는 사랑의 꽃!
25화 프린스의 유령?
26화 놀라운 아버지의 비밀

[Disc 6]
27화 거미 지옥의 여 전사
28화 독타맨 암살
29화 도쿄가 사라지는 날?
30화 최강 캔스의 마검
31화 신형?! 메가스 출현

독타맨의 정체는, 카게야마 히데오라고하는 나쁜 천재 과학자였다. 이것을 안 메이슨, 파라, 몬스터의 빅쓰리는,쿠테타 일으켜 기어를 빼앗으려 한다. 독타맨 암살계획은 성공한 것처럼 보였지만…….!?

[Disc 7]
32화 기어의 대 개조 작전
33화 나오는 건가? 신 필살기술
34화 보라! 바이오의 힘
35화 6번째 남자
36화 변신 보이

[Disc 8]
37화 킬러 실버!
38화 수수께끼의 바르지온
39화 메이슨의 함정!
40화 빼앗긴 터보!
41화 악마의 자장가!

갑자기, 네오구라도로부터 네오메가쟈이칸을 빼앗은 수수께끼의 그림자.
그 정체는, 바이오헌터ㆍ실버였다. 실버는 바이바스타에서 바이오맨을 집중공략. 최강의 적ㆍ실버에게 바이오맨은 이기는것이 가능한 것일까? 그리고, 실버의 상대 “바이오맨” 이란!?

[Disc 9]
42화 고! 생명을 걸어라
43화 세일러복의 전사
44화 아름다운 양심회로
45화 인간폭탄 쥰!
46화 탈출! 함정의 마을!

[Disc 10]
47화 시바타박사의 정체?
48화 출현! 바르지온
49화 위태로운 바이오 로봇
50화 돌격 네오그라드
51화 최종화 안녕! 피보

독타맨의 아들ㆍ슈이치와 행동을 함께하고 있었다. 시바타박사의정체는, 무려 고시로의 아버지ㆍ신이치로였다. 게다가 신 이치로는, 메카인간을 연구하기 위해, 자신의 몸을 기계화하고 있던 것이다. 충격의 사실이 판명하는 중, 마침내 바루지온이 출현. 이 무적의 힘을 손에 넣는 것은 실버 일까? 혹은 독타맨 일까! 최후결전이, 눈앞에 다가왔다! / 바이오맨, 평화로운 지구를 돌려놔!!