서울대 여성연구소는 여성과 젠더에 관한 다양한 주제를 조사연구하고 이론을 개발할 목적으로 2001년 서울대학교의 여러 전공 교수들이 참여하여 설립되었다. 독자성과 학제성을 함께 지니는 여성학의 특성에 부합할 수 있도록 여성연구소는 대학원 과정인 여성학협동과정을 비롯해서 여러 분과학문들과 유연하게 결합해왔다. 이를 통해서 한국의 사회적 조건과 역사를 기반으로 한 젠더 연구 및 교육의 기틀을 마련하는 데 주력하는 한편, 현실적이고 실천적인 변화를 위한 정책 제시에도 힘쓰고 있다.