1부 미생물에 대한 소개
1 미생물의 진화와 미생물학
2 현미경학
3 세균의 세포 구조
4 고균의 세포 구조
5 진핵세포의 구조
6 바이러스와 비세포성 감염인자

2부 미생물의 영양, 생장 및 조절
7 세균과 고균의 생장
8 환경에서 미생물의 제어
9 항미생물 화학치료

3부 미생물 물질대사
10 물질대사 개론
11 이화작용: 에너지 방출과 보존
12 동화작용: 생합성 과정에서 에너지 이용

4부 미생물 분자생물학과 유전학
13 세균 유전체의 복제와 발현
14 세균의 세포과정 조절
15 진핵생물과 고균의 유전체 복제 및 발현
16 유전 변이 기전
17 미생물 DNA 기술
18 미생물 유전체학

5부 미생물 세계의 다양성
19 고균
20 비프로테오박테리아 그람음성
21 프로테오박테리아
22 그람양성 세균
23 원생생물
24 진균
25 바이러스

6부 생태와 공생
26 생태계의 미생물 탐험
27 미생물의 상호작용
28 생물지구화학적 순환과 지구기후 변화
29 해양 및 담수 생태계의 미생물
30 토양생태계의 미생물

7부 병원성과 숙주반응
31 선천성 숙주 저항
32 적응면역
33 미생물과 사람이 공존하는 생태계
34 감염과 병원성

8부 미생물에 의한 질병, 검출 및 조절
35 역학 및 공중보건 미생물학
36 임상미생물학 및 면역학
37 바이러스와 프리온에 의한 질병
38 세균에 의한 질병
39 진균과 원생생물에 의한 질병

9부 응용미생물학
40 식품미생물학
41 생물공학과 산업미생물학
42 응용환경 미생물학