물질의 최소 단위인 원자는 ‘양성자(+), 중성자(0), 전자(-)’, 즉 ‘양·중·음’ 3개의 요소로 이루어져 있고, 이것을 괘상으로 치환하면 천·인·지 삼효(三爻)로 구성된 괘체로 표상할 수 있다. 그리고 원자와 원자가 상호작용함으로써 형성하는 사물은 천지인 삼효가 상하로 중첩되어 육효로써 상호작용하는 64괘로 표상할 수 있다.

입자는 자갈처럼 구분되어 뭉쳐있는 것이 아니라 입자이면서 동시에 파장으로 상호연결되어 하나(一)로써 존재하는 유기적 일체의 생명을 의미한다. 음효와 양효도 각각 홀로는 존재할 수 없으며 어떤 의미도 부여될 수 없지만, 상호작용을 통해 세 개의 효가 일체가 되어 하나의 괘를 세울 때 비로소 사물의 극성을 나타낸다. 이는 천지가 하나된 인(人), 음양이 하나된 중(中)을 이룰 때 비로소 우주는 일체 생명(一)이라는 인문 · 철학적 의미를 갖게 된다는 것을 의미한다. 이것은 우주를 “분리된 부분들의 집합체라기보다 통합된 전체로 보는 전일적 세계관(holistic worldview), 또는 생태학적 세계관(ecological worldview)”이라고 정의할 수 있다. 양중음(陽中陰)으로 구성된 원자가 상호작용함으로써 분자라는 변화를 만들어내듯이, 천인지(天人地) 삼효로 이루어진 소성괘는 상하로 중첩되어 상호작용을 함으로써 만물의 변화를 표상해 낸다.
　
현대물리학이 발견한 사물의 초미세 영역으로 들어가 보면 거시세계에서 발견되는 원리와 법칙이 무시되는 또 다른 신비한 세계가 펼쳐진다. 모든 물질은 초미세 입자인 원자로 이루어져 있으며, 원자는 그 안에 쿼크(quark)라는 이름의 더 작은 요소들을 포함하고 있다. 입자는 더 깊이 안으로 들어가 보면 결국 파동으로 나타나고, 이는 양자장이라는 ‘입자와 파동의 이중성’으로 귀결된다. 미시세계는 거시세계에서의 ‘위치와 운동량의 법칙’이 무시되는 불확정한 상태에 놓여 있다. 초미세 영역인 원자 세계에서의 모순적이고 무질서하며 불확정한 상태가 어느 시점과 어느 지점에서 거시세계의 기계적인 인과율이 적용되기 시작하는지는 아직 과학적으로 증명된 바는 없다. 뉴턴은 신이 입자와 입자들 사이에서 작용하는 힘, 그리고 변하지 않는 불변의 법칙을 태초에 창조하였다고 생각했다. 그래서 ‘모든 사건은 그것에 따른 원인을 가지고 있다’라고 보았다. 그런데 양자론은 원인 없이 일어나는 결과를 허용함으로써 ‘원인과 결과’의 인과론적 사슬을 끊어버리게 된다.
　
원자를 벽돌처럼 쌓아 올린다고 해서 생명이 나오지는 않는다. 상호작용을 통한 중화가 일어나고, 그 중화들이 모여 상호작용의 상승을 일으키며 더 큰 중화를 만들어내는 과정에서 수리적이고 과학적인 ‘자발적 자기 조직화’를 통해 물질이 생화되고, 어느 순간 생생지도로써 물질의 영속을 위한 조리주체가 생명으로 내재된다. 생명이란 물질과 마찬가지로 음양의 상호작용에 따른 중화작용을 통해서 발아된다. 이것은 기(氣)에 내재하고 있던 리(理)가 상호작용의 과정을 통해서 신묘한 이치로써 생명으로 발현되는 것이라 할 수 있다. 역(易)은 이 신묘한 이치를 음양불측지위신(‘陰陽不測之謂神)’이라 정의하고 있다. 그래서 공자는 “변화의 도를 아는 자는 신의 하는 바를 알 것이다.” 라고 까지 하고 있다.
　
헤아릴 수 없는 음양의 대소 · 장단 · 강약의 극미세한 차이가 잡란한 에너지의 불균형과 모순을 만들어내면서 다양한 상호작용을 일으키는 동인이 되고, 이것은 다양한 양태의 중화를 창조하는 신묘한 이치가 된다. 천지인 만물의 씨앗이 물감처럼 혼융되어 있는 태허는 일종의 동력이라 할 수 있는 음양미분 상태로서 상대적 작용성이 없는 부동의 상태라 할 수 있다. 기운이 극에 달하는 어느 순간, 음양의 균형이 어긋나면서 상대성이 분열을 시작하고, 강유상추 상호작용을 시작하면서 품고 있는 씨앗(理)을 천지에 펼쳐놓는다. 음양의 불균형은 에너지의 이동을 불러일으킴으로써 음양의 대소 · 장단 · 강약이 만들어내는 신묘한 창조적 이치는 혼융되어있는 물감을 만물만상으로 천하에 펼쳐놓는다. 이는 부동의 태허가 음양의 상호작용으로 동적인 태극으로 전환되는 것을 의미하며, 우주가 창조되는 물리학적 빅뱅(bigbang)의 순간이 된다. 즉 태허는 천지인이라는 소립자를 품고 있는 물리학적 양자장으로 비유할 수 있다. 다시 말하면, 음양의 불균형과 모순이 만들어내는 기의 역동적 흐름은 우주라는 도화지에 다양한 색채로 만물을 그렸다 지웠다를 반복하는 기의 취산 활동에 비유할 수 있는 것이다.