1999년 4월부터 수출입을 위한 통관절차가 대폭 간소화되고 통관 소요시간도 크게 줄어든다. 수입의 경우 전기통신기본법, 품질경영촉진법, 전파법 등 16개 법령에 해당하는 물품은 세관장 확인절차가 완전히 폐지되고, 약사법, 식품위생법 등 13개 법령에 해당되는 물품은 국민보건, 사회안전 등 국가질서 유지와 관련되는 경우에만 세관장 확인을 거치게 된다. 또 수출의 경우 3개 법령은 세관장의 확인절차가 없어지고 1개 법령은 확인범위가 축소된다.

관세청은 '통관요건 확인기관과 관세청간의 전산망 연계체제가 마무리되면서 중복되는 확인 절차를 축소 조정해 통관규제를 완화하게 되었다'며 고객에게는 원스톱 서비스를 제공하는 대신 투명성은 한층 더 높일 수 있는 계기를 마련했다고 밝혔다. 이번에 세관장의 확인대상에서 제외되는 품목은 수입의 경우 금액기준 49%, 건수기준 52% 수출은 금액기준 61%,건수기준59%에 해당한다.

세관장의 확인대상에서 제외되는 물품은 소관부처나 협회,단체 등과 전산망을 연계해 통관자료를 실시간에 전송해 해당기관이 필요한 관리를 사후적으로 수행하게 된다. 그 동안 세관장의 확인을 거쳐 통관하는데는 평균 17일이 걸렸다. 그러나 이제는 세관과정의 확인을 거치지 않는 품목은 수출의 경우 평균 1분으로 수입은 평균 5일로 줄어들고 확인대상 품목도 평균 15일 이내로 줄어든다. 관세청은 통관절차 간소화로 무역업계는 창고보관료, 금융비용 등을 포함해 3,000억원 이상의 비용절감효과가 기대된다고 밝혔다.