2주 전의 원자 빨대 소동에도 불구하고, 앤드류는 주디의 부모님을 따라 하와이로 여행을 떠난다. 발명가이자 과학자인 알 삼촌은 때마침 대왕오징어를 찾아 보호하기 위해 물방개호라는 수중 탐사선을 만들고 있었는데, 앤드류는 바쁜 삼촌을 도우려다가 그만 자기 자신과 주디, 터드를 물방개호 안에 가두고 만다. 게다가 이번에도 아차 실수하는 바람에 물방개호는 저절로 움직이면서 바다 속으로 들어가 표류하게 되는데……. 앤드류는 바다 속에서 영영 길을 잃기 전에 물방개호를 조종할 수 있게 될 것인지, 귀상어와 돌고래 등 셀 수 없이 많은 바다 생물을 만나게 된다.
6권에서 앤드류와 주디, 터드에게 새로운 적이 나타난다. 그 적의 이름은 소기 밥 슬로긴스. 이 욕심쟁이 악당은 바다 속을 어슬렁거리며 진귀한 대왕오징어를 찾는 중이다. 대왕오징어를 찾아서 보호하려는 게 아니라 간식거리로 만들 속셈으로. 앤드류와 주디, 터드는 소기 밥을 막고 싶었지만 그러기도 전에 고래한테 잡아먹히고 만다. 과연 앤드류 일행은 고래 뱃속에서 나와 대왕오징어를 구할 수 있을까? 아니, 고래 뱃속에서 나올 수나 있을까?
7권에서 앤드류와 주디, 터드는 대왕오징어를 찾으려다가 물방개호를 오스트레일리아의 그레이트배리어리프까지 몰고 간다. 하지만 그곳은 푸른고리문어, 청자고둥, 입방해파리 등 지구에서 가장 무서운 생물들이 살고 있는 곳이다. 게다가 나쁜 악당 소기 밥에게 물방개호를 빼앗기고 만다. 앤드류와 주디는 산호초 사이의 미로를 빠져 나가 물방개호를 되찾아야만 한다. 목숨을 위협하는 생물들에게 물어뜯기기 전에! 반드시!
8권에서 앤드류와 주디, 터드는 물방개호를 타고 수심 1만 미터가 넘는 심해로 내려간다. 지금까지 두 사람밖에 간 적이 없다는, 아주 깊은 바다 속이다. 심해에서는 바다 생물들이 내뿜는 작은 불빛 말고는 아무것도 보이지 않는다. 그러나 지구에서 가장 깊은 곳을 지나가려는 그때, 불행하게도 물방개호의 시동이 그만 꺼져 버리고 마는데……. 대왕오징어보다 자신들을 먼저 구해야 할 처지가 되고 만 앤드류와 주디는 과연 소기 밥으로부터 대왕오징어를 지켜낼 수 있을까? 아니면 칠흑 같은 심해 바닥에서 영원히 빠져 나오지 못할까?