또 다시 CIA에게 쫓기게 된 제이슨 본은 사랑하는 마리를 잃고, 더욱 혼란에 빠지게 되는데...

기억상실증에 걸린 전직 CIA의 요원 제이슨 본은 밤마다 알 수 없는 악몽에 시달린다. 그 악몽이 바로 자신이 예전에 실제로 겪었던 일임을 확신하는 제이슨 본. 그는 자신을 제거하려는 CIA를 피해 연인 마리와 함께 떠돌이 생활을 하지만, 왜 자신이 쫓겨야 하는 이유조차 모른다.

살아남기 위해서 이유도 모르는 도피생활을 하고 다니는 것이다. 인도 고어에서 마리와 평범한 생활을 하는 중에도 자신의 정체성에 대한 흔적들을 모으고 있었다.

그러던 어느 날, 제이슨 본은 누군가가 자신을 찾아다니는 것을 보게 되고, 마리와 함께 짐을 챙겨 도주를 시작한다. 쫓고 쫓기는 와중에 연인 마리는 CIA 요원에게 살해되고, 제이슨 본은 자신이 모종의 음모에 연루되어 있음을 알게 된다.

세상에서 자신을 인정해주던 유일한 사람인 마리가 사라지자, 제이슨 본은 더욱 더 혼란스러워지기 시작한다. 그러나, 아직까지 CIA에서 자신을 쫓는 것을 이상하게 생각한 본은 또다시 자신의 정체성을 찾기 시작한다.

제이슨은 이 모든 일이 CIA에 의해 이루어졌다고 깨닫는다. 그들이 현재 베를린에 있음을 알게 된 제이슨은 복수를 맹세하며 킬러를 쫓는데, 어렴풋이 떠오르는 기억들과, 직접 찾아낸 여러가지 단서들을 조각조각 이어 붙여 퍼즐을 맞춰가던 제이슨 본은 단서를 찾아낸다.

자신이 러시아 하원의원 네스키와 그 부인의 피살사건과 어떻게든 연관돼있음을 알게 된 것이다...