의학교로 체재가 바뀌는 것에 대해 대한의원에서 현재 근무하는 관리를 모두 내보내고 다시 선택 임명한다는 소문이 도는 등 민심은 이를 반겨하지 않았다. 의육부가 부속 의학교로 개칭되기 직전인 1월 31일 교수 유병필은 교수직을 사임하였다. 유병필 대신 대한의원의 기사로 있던 사이토가 교수로 임명되었다. 스크랜턴은 1910년 1월 20일 교수직을 사임하였다.
이전에는 국한문 교과서로 일본인 교수가 가르치면 한국인 교수가 통역하였지만 실제 강의에 불편이 많았다. 따라서 1909년 4월 중순 부속 의학교는 규칙에 있는 대로 신학기부터는 일본인 교수가 직접 강의하고 통역을 없애기로 하였다. 이에 대해 많은 직원들은 찬성했고 직원회의를 개최하였으나 해결되지 않았다. 한편 4월 29일 지석영 등은 새 학기부터 일본어로 가르치는 것은 시기상조라는 의견을 내부 위생국에 제출하였다.결국 강의도 일본어로 진행되면서 대한의원부속 의학교는 한일합방이 되기 이전에 이미 일본의 식민지 의학교육기관이 되어 있었다.
--- 「제3부 2장 대한의원 교육부, 의육부, 부속 의학교」 중에서


물어보니 바로 선생이 홍 과장이시란다. 선생이 들어가시면 C는 또 다시 자기의 설명을 계속한다.
척신유생(瘠身儒生)의 학교 서기가 문서를 들고 와서 과장실로 들어가더니 한참 만에 나오면서 ‘네! 네! 그럼 그렇게 하겠습니다.’하고 말한다. 아마 과장 선생은 학감을 겸임하신 모양이다. 그러면 이곳이 제반 학교사업에는 중추기관이다.
한 모퉁이에서 실습생들의 수군거리는 정담 소리에 귀를 기울였다.

A: ‘야! 참 홍 선생은 그 자제들에겐 격별한 애정이 많으시더라.’
B: ‘암 그렇지. 그러나 一--의 사심이 없으시단다.’
C: ‘옛날 학감은 참 -- 봉지위인(棒之偉人)이지만 지금 학감 선생님은 언제든지 아버지 같은 선생님이시다.’
B: ‘자! 내 표본을 보아! 상상을 하겠지?’
A: ‘하 ……’
A: ‘야 C의사는 꼭 홍 선생님의 흉내만 내는구나.’
C: ‘말을 말게 홍 선생님의 수술하시는 묘기나 배웠으면 그만이지 말씀하시는 흉내까지 내더라니까’
B: ‘야, 우리들은 오히려 손해일세. 이 이비인후과에서 보이로 있다가 의사된 사람이 벌써 둘이나 된다네. 그 사람들은 매월 돈 받아먹으면서도 의사가 되지만 우리는 일년에 백여 원을 받치고 그나마도 낙제나 하면 … 오도 가도 못하고’
A: ‘그래 홍 선생님 곁에서 심부름을 하니 그렇게 안 될 리 있나'