1회 - 변화의 봄바람
눈 오는 어느 날, 아사히야마 동물원은 위기에 처해 있다.
날로 줄어가는 동물원 관람객으로 시청에서는 동물원을 폐원하기로 한다.
폐원을 막기 위해 동물원 직원들은 머리를 감싸고 골몰한다.
하지만 신조는 이미 반쯤은 가망 없는 동물원을 그만두고 도쿄로 떠날 생각을 하고..

2회 - 목표없는 인간
신조는 도쿄로 가기로 결정한 후 원장에게 사직서를 낸다.
한편 사유리가 아끼던 기린 해기의 죽음과 그 때문에 쓰러지는 사유리를 발견한다.
그녀의 불행한 과거를 알게 된 신조는 그녀를 지켜주고 싶다는 열망으로 가득 차는데..

3회 - 열정과 업
신조는 동물원을 명소로 만들기 위해 골몰한다.
그리고 신조는 단골 라면 가게 주인 '구로사와'에게서 ‘업의 개념’이란 말을 듣는다.
동물원 직원들은 이에 대해서 열성적으로 토론하며 발전의 가능성을 모색한다.

4회 - 창조 아이디어
원장은 동물원에 영업 전문가 아톰을 초빙하고 직원들은 아톰에 의해 발상의 전환을 깨우친다. 이를 기점으로 동물원은 개선과 발전을 시작한다.
직원들 사이에서는 동물에 대해 더 알기 위한 학습 토론회를 열며 열정을 불태우는데..

5회 - 신뢰를 회복하라
장마의 시작으로 관람객의 발길은 뚝 끊기고 고릴라와 여우원숭이가 죽는다.
원인은 에키노코쿠스증이라는 심각한 병으로, 동물원은 이 사태를 외부에 알려야 하나, 말아야 하나에 대해 고민한다. 동물원의 평판은 바닥을 치지만 시간이 지날수록 시민들도 직원들의 노력을 헤아리고 신뢰의 눈길을 보내기 시작한다.

6회 - 마지막 기회
다시 겨울. 동물원은 폐원 되지 않았다.
원장은 시청에 가서 1억 엔이라는 예산을 확보해오고 직원들은 예산을 성공적으로 사용하여 관람객을 늘리는 방안을 내놓는 데 바쁘다. 한편 사유리는 마에다에 대한 그리움과 아버지에 대한 좌절로 점점 신체적으로, 정신적으로 약해져 간다.

7회 - 하늘을 나는 펭귄
사유리가 스스로를 펭귄으로 비유한 이후부터 신조는 펭귄을 주목한다.
신조는 펭귄의 비행이라는 새로운 발상을 하고, 원장은 그의 발상이 현실이 될 수 있도록 적극적으로 도와준다. 신조는 사유리를 위해서라도 꼭 펭귄의 나는 모습을 보여주겠다고 결심하고 원장, 유키, 아이들, 구로사와, 아톰의 도움을 받으며 꿈을 실현할 준비를 한다.

8회 - 펭귄을 날게하라
아이디어가 잘 떠오르지 않아 조급해진 신조는 드디어 펭귄을 날게 하는 방법을 고안해낸다. 관람객들이 펭귄의 헤엄치는 모습을 아래에서 볼 수 있도록 구조한 펭귄 수족관은 척척 진행되고, 신조는 사유리에게 프로포즈할 계획을 세운다.