순수하게 정치적인 면만을 놓고 고려할 때 그린스펀의 시대에서 가장 주목할 만한 시기는 아마도 빌 클린턴 행정부 시대일 것이다. 폭풍 같았던 부시 행정부 시기를 겪은 후 공화당 지배하에 있던 연준은 12년만의 맞이한 민주당 행정부에 무엇을 기대해야 할지 몰랐다. 클린턴과 연준 간의 관계는 연준이 1994년 2월에 금리인상을 재개한 후에도 표면적으로 원만했다. 사실 그린스펀과 클린턴, 그리고 내각은 서로 밀접하여 누군가 그린스펀이 실질적으로 클린턴 경제팀의 멤버가 될 것을 제안했었다. 그러나 문제는 그것보다 더 복잡했다.

그린스펀은 클린턴, 재무장관 로이드 벤센과 '따뜻하고' '우호적인' 관계를 즐겼지만, 자신이 그들과 협력했는지 혹은 정책상 조언을 주었는지는 잘 모르게싿고 말한다. 전 아칸소 주지사였던 클린턴은 그의 전임자들보다 연준과의 관계를 잘 유지했다. 클린턴의 자문관이자 후에 연준의 부의장이 된 앨런 블라인더는 "재무장관 벤센, 차관 로저 알트먼, NEC 의장 로버트 루빈, CEA 의장 로라 타이슨 등 클린턴 팀의 거의 모두가 연준을 공격하는 것은 좋은 정책이 아니라는 견해를 가졌다. 나는 그것이 옳았고 행정부가 이런 노선을 유지하 것은 잘한 일이라고 생각한다. 물론 그것은 경제가 잘 풀릴 경우였고 만약 경제가 나빴다면 이런 정책이 꼬였을지도 모르지만 다행히 경제는 좋았다"고 말한다. 벤센은 전임자와는 반대로 그린스펀과 공식적으로나 사적으로 굉장히 좋은 관계를 가졌다고 말한다.