〈수학에 번쩍 눈뜨게 한 비밀 친구들 4〉에서는 내 친구 같은 백설기가 학교와 집에서 생활하면서 벌어지는 일들과 이를 해결하는 과정이 재기발랄하게 전개되고, 그 속에서 교과서에서 배우는 수학 원리를 저절로 익히게 됩니다. 그리고 백설기의 소중한 비밀 친구들이 수학 원리를 콕 집어서 다시 정리해 줍니다. 이야기가 끝나면 수학의 원리와 관련된 흥미로운 뒷이야기들이 펼쳐집니다.

4권에서는 한미남의 아빠와 쿠키 가게 사장님들의 관계, 한미남 아빠를 협박한 비밀 단체 등 새로운 사실들이 밝혀집니다. 어느 날, 사라졌던 한미남의 아빠가 쿠키 가게를 찾아옵니다. 백설기는 아빠를 만나 기뻐하는 한미남을 보며 흐뭇해합니다. 그런데 한미남을 먼저 집으로 보낸 한미남 아빠는 백설기에게 쪽지와 열쇄를 남기고 검은 양복의 남자들을 따라 갑니다. 백설기는 쪽지와 열쇄를 이용해 한미남 아빠가 남긴 검은 상자를 찾습니다. 쿠키 가게 사장님들의 도움으로 상자를 연 백설기는 한미남 아빠를 협박했던 비밀 단체에 대해 듣게 됩니다.

한편, 백설기 주변에 새로운 인물들이 등장합니다. 백설기 반에 전학 온 아이는 거울을 이용해 백설기와 아이들을 깜짝 놀라게 하고, 김수학 아저씨는 유치원 선생님을 만나 사랑에 빠집니다. 백설기는 사촌 동생과 놀이 공원에도 가고, 김수학 아저씨를 멋쟁이로 만드는 등 여러 사건들을 통해 수학 원리를 배우게 됩니다.

그러던 중, 백설기는 한미남의 아빠를 협박했던 의문의 비밀 단체가 아이들의 명단을 모은다는 소식을 듣게 됩니다. 그런데 그 명단에 한미남의 이름이 들어있는 것을 알게 됩니다. 과연 비밀 단체의 정체는 무엇이고, 한미남을 노리는 이유는 무엇일까요?
백설기와 수학 친구들의 비밀스런 수학 이야기는 마지막 결말을 향해 나아갑니다.