레이어란 투명의 아세테이트 층을 다른 것 위에 올려놓아 분리된 공간을 만드는 것이다. 어떤 이미지 작업을 하기 전에 레이어를 더 추가하여 분리된 층에서 각각의 이미지를 다양한 효과와 레이어 옵션을 적용해 조작하고, 하나의 합성 이미지로 만든다면 작업이 편리해진다. 포토샵이나 이미지레디에서 신규 이미지를 열면 하나의 레이어를 가지고 있음을 레이어 팔레트에서 볼 수 있다.

이 레이어는 'Background'라고 불리우는데 페인팅의 기본 레이어로 사용된다. 모든 레이어의 맨 밑에 위치하는 'Background'만은 층을 바꾸거나 블렌딩 모드, 불투명도 같은 레이어 옵션을 적용할 수 없다. 하나의 파일에서 모든 레이어는 같은 해상도와 같은 채널 수 그리고 같은 이미지 모드를 가진다.

레이어에서 이미지가 없는 부분은 레이어의 투명 영역을 통해 밑의 레이어에 있는 이미지를 볼 수 있다. 다른 것의 방해 없이 하나의 레이어에서 드로잉, 편집, 붙이기 그리고 위치 이동을 할 수 있다. 결합하거나 합치기 전까지 각 레이어는 이미지에서 다른 것들과 득립적인 상태로 남는다. 이런 이유로 그래픽, 타입 그리고 블렌딩 모드 게다가 레이어 마스크, 레이어 스타일 그리고 컨텐트 레이어 같은 특별한 기능으로 자유롭게 작업할 수 있다. 이미지레디에서 또한 롤오버 상태나 애니메이션에 사용할 수도 있다.

포토샵과 이미지레디 사이에서 레이어된 이미지를 옮길 때 모든 레이어들, 레이어 마스크, 레이어 스타일 그리고 컨텐트 레이어는 보호된다. (컨텐트 레이어는 포토샵에서만 적용하거나 편집할 수 있고, 이미지레디에서는 보이기만 한다.)