미래. 사이보그 등 인체개조기술이 발달해 인간의 목숨값이 한없이 낮아진 세계. 공중도시 자렘이 지상을 지배하고, 그 아래에는 자렘에서 토해낸 쓰레기 더미를 중심으로 고철마을이라 불리는 독자적인 사회가 형성되어 있다.

고철마을의 사이버네틱 의사 이도는 쓰레기더미 속에서 사이보그의 머리 잔해를 발견한다. 수백 년의 세월을 뛰어넘어 기적적으로 되살아난 소녀에게는 갈리라는 이름을 붙여준다.
기억은 잃었지만 갈리의 몸은 전설적인 격투술 판처 쿤스트(기갑술)를 기억하고 있었다.

이도와 함께 헌터 워리어로 일하기 시작한 갈리는 수많은 만남과 이별을 겪으며 조금씩 성장해나간다.
그리고 어떤 사건을 계기로 광기의 과학자 노바를 추적하다가 자렘인 지배에 맞서 싸우게 된다.

친구 루를 구하기 위해 우주도시 예루로 향한 갈리와 일행은 루의 뇌를 탈환하는 데에 성공하지만 이번에는 자렘과 고철마을에 위기가 닥친다. 고향을 지키기 위해 ZOTT에서 우승하겠다고 맹세하고 수많은 난적과 싸워 승리하는 갈리와 스페이스 엔젤스 멤버.

총몽 2nd 시리즈 완결편! 이제 이야기는 새로운 무대를 향해 도약한다!!

갈리 일행이 격전을 치르는 동안 지상에서는
포기어가 갈리의 사망 소식을 전해듣고 진위를 확인하기 위해 길을 떠난다.
갈리의 흔적을 쫓다 황야에서 우연히 이도를 만나 함께 갈리를 찾아나서는 포기어.
마침내 단서를 포락해 우주로 향하는데…!