『탄압받는 과학자들과 그들의 발견』은 지난 100여 년 동안 오늘날의 경제적, 문화적 변화보다 훨씬 급진적인 발전을 가져올 수 있었던 천재 과학자들의 발명과 발견에 대한 기득권 세력들의 탄압과 은폐의 역사를 적나라하게 드러낸 역작이다. 발간 당시 전 세계의 주요 언론들이 센세이션을 일으키며 주목을 받았던 이 책은 지배적인 패러다임을 지키기 위해 이데올로기로 무장한 제도권 과학의 비인도적 탄압을 고발하는 한편, 그러한 탄압의 역사를 넘어 위대하고 혁신적인 발명과 발견들이 언젠가는 인류의 소중한 재산이 될 것이라는 희망의 전언도 함께 싣고 있다.

현재 탄압받는 대체의학을 알리기 위한 폭넓은 활동을 벌이고 있는 조나단 에이센은 수많은 과학 저널에 수록되었던 글들을 수록함으로써 대체의학, 독립과학, 대체에너지, UFO 기술 등 다양한 분야에서 이루어진 혁신적 발견들과 그에 대한 제도권의 저항을 극적으로 드러내 보이고 있다.

제1부 대체의학에 대한 탄압
무소불위의 제약회사와 그 대리인인 제도권 의학단체들은 수백만 달러의 손해를 감수하면서까지 암이나 AIDS와 같은 질병을 효과적으로 치료하는 무해하고 저렴한 치료법을 받아들일 준비가 전혀 안 되어 있다. 반대로 수많은 환자들은 갖가지 퇴행성 질환에 시달리면서도 그같은 치료법은 꿈도 꾸지 못하고, 심지어 사망 선고를 받기 전까지 그런 치료법이 있다는 사실조차 알지 못하는 경우도 있다. 기존의 보수적인 기득권 세력에 부딪혀 그동안 수천명의 생명이 그 대가로 치러져 왔다. 제1부에서는 여태까지 불치병 혹은 치명적인 질병으로 알려졌던 질병들에 대한 몇몇 획기적인 치료법들을 실었다. 이 치료법들은 많은 사람들을 통해 그 효과가 입증되었지만, 모든 암이나 AIDS, 퇴행적 질병에 대해 최선이라고 할 수는 없다. 생명을 위협하는 질병에 관해 어떤 치료방법을 선택하느냐 하는 것은 매우 중요한 문제이다. 개개인이 어떤 방법을 선택할 것인가는 반드시 폭넓게 자료들을 읽고 전문가와 상의하여 결정할 필요가 있다.

제2부 비제도권 과학에 대한 탄압
제도권 과학은 '과학적 방법론'을 포함한 모든 연구와 발견을 검열하는 교리로서의 엄격한 가이드라인을 통해 스스로를 감시한다. 과학자들이 자신의 업적을 객관적으로 평가할 수 있다면, 진리는 독점될 수 없다는 인식에 어렵지 않게 도달할 수 있었으리라. 그것이 여태껏 쌓아온 자신의 위치를 잠식할 수 있는 것일지라도. 소위 학문의 일가를 이루었다는 사람이 답을, 심지어는 어떤 물음이 있는지도 모른다는 것은, 더구나 그 사실을 인정해야 한다는 것은 얼마나 슬픈 일인가? 인류의 발전보다 항구적인 현상 유지를 목적으로 하는 체제가 어떻게 그런 급진적 사상을 수용할 수 있겠는가?

제3부 UFO 기술과 외계 접촉에 대한 탄압
3부에서는 미국 정부가 UFO와 외계인 문제에 깊이 관여하고 있다는 사실에 대해 다루었다. 소위 최고 전문가들은 그보다 높은 권력에 대해 실제로 얼마나 비굴했던가? 외계 생명체와 관련된 예민한 정보는 그렇게 검열을 통해 지배적인 사회, 종교, 정치제도를 혼란시키지 않기 위한다는 명목으로 세심하게 조율되어 왔던 것이다. 외계 생명체와의 모종의 거래로 인해 우주 시대에 있어서의 기득권 획득, 달탐사에 감추어진 비밀들이 단순한 억측만은 아니라는 증거를 제시한다.

제4부 에너지 절약 장치와 대체에너지원에 대한 탄압
4부에서는 화석연료에 대한 의존을 중단시키고, 원자력 에너지의 치명적인 위협을 줄여줄 수 있는 대체 에너지원을 소개하였다. 지금은 물로 자동차를 움직이거나, 대기의 충만된 자유 에너지로 불을 밝히지 못하고 있다. 불가능해서가 아니다. 그런 에너지는 이미 몇십 년 전에 개발되었다. 하지만 이 세계가 청정하고 안전한, 그리고 풍부한 에너지에 의해 움직인다면, 지금까지 독점적인 지위를 누리던 전력과 석유회사들이 종말을 맞게 될 것이기 때문이다. 환경을 파괴하고 우리의 삶을 위협하는 체제를 유지하는 것이 이들 독점기업의 최대의 이해관계였던 것이다.